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INGENIEUR DE RECHERCHE EN BIO-INFORMATIQUE H/F - SAINT-CONTEST
Type de contrat :
Contrat durée déterminée
Description :
Missions principales :
Rattaché(e) au pôle Recherche, Développement, Innovation de LABÉO, vous rejoignez une équipe à taille humaine, conviviale et stimulante. Votre mission au sein de cette équipe de chercheurs sera d’assurer l’ensemble des analyses in silico des données de séquençages NGS, de génotypage à haut débit ou de métabolomique aussi bien au niveau procaryote qu’eucaryote. Les projets concernent principalement des applications de métagénomique (16S et shotgun), de séquençage de génomes complets, de transcriptomique ou d’étude d’association pangénomique. L’ensemble de ces projets permet de répondre aux attentes nombreuses des filières économiques normandes : équine, conchylicole, bovine, apicole etc.
Contexte :
Vous recherchez un environnement de travail stimulant et proactif s’inscrivant dans le cadre de collaborations multidisciplinaires en lien avec des partenaires locaux (Centre François Baclesse, GIS Centaure) nationaux (INRAe) et internationaux (UK, USA etc.)
Vos fonctions s’organisent selon les missions suivantes :
- Réaliser les analyses in silico de données « omiques »
- Développer des nouveaux pipelines d’analyses bioinformatiques pour des applications variées : métagénomique, WGS, GWAS etc.
- Participer à la valorisation des résultats par la rédaction des rapports et des articles scientifiques ; les présentations à différents congrès (inter)nationaux
- Interagir avec les collaborateurs scientifiques de LABÉO, de l’Université de Caen/Rouen et des partenaires[MG1]
- Assurer la veille scientifique et technologique dans votre domaine et Identifier les besoins stratégiques
- Préparer des comptes-rendus réguliers sur l’avancement des travaux et être en mesure de les présenter.
- Encadrer des étudiants de tous niveaux
Ces responsabilités ne sont pas limitatives.
Profil :
- Bac + 5 spécialisé en bio-informatique ou équivalent, avec expérience préalable d’au moins 2 ans dans le traitement et l’analyse de données « Omiques ».
- Bonne compétence en bio-informatique des génomes, notamment dans l'analyse des données de séquençages d'ADN et d’ARN (algorithmes et outils d’assemblage de génomes/transcriptomes).
- Maitrise parfaite du système Linux ainsi que des différents langages de programmation/Script : Python/Perl/Java/Bash/R
- Des connaissance en biologie moléculaire serait un plus.
- Qualités recherchées : Rigoureux, motivé, autonome, curieux, aimant le travail en équipe
Nombreux avantages :
Carte tickets restaurant, possibilité de télétravail, prime de vacances, aide au logement, mutuelle,
Poste à pourvoir au 3 juin 2024
Tos nos postes sont ouverts aux personnes en situation de handicap.
Salaire :
Entre 35000 € et 40000 €
Minimum d'études :
Bac +5
Minimum d'expérience :
2-5 année(s)